Когда случаются проблемы с файловой системой на сервере, первое что нужно делать после скачки бэкапов:

Загрузиться в single mode (возможно потребуется попросить KVM)

# mount -u -w
# fsck -y
# reboot

Если радости нет, и в консоли вы видите: «mount: not found» и «fsck: not found», то пробуйте указать полные пути:

# /sbin/mount -u -w
# /sbin/fsck -y