В сериале рассказывается история девятнадцатилетнего студента Питера Паркера, который учится на первом курсе университета и о его тайном втором «Я», Человеке — пауке. История начинается с того, что Питер уже имеет свои необычные способности, поэтому зритель не сразу узнает, почему так получилось и, как именно обычный студент университета сумел превратиться в сверхчеловека. Он, кроме учебы, еще работает фотографом в редакции Дэйли Бьюгл. В истории показали большинство классических злодеев: Амбала, Ящера, Зелёного Гоблина, Скорпиона, Доктора Осьминога, Носорога, Мистерио, Шокера, Стервятника и Хамелеона. Так же здесь появились и более новые малоизвестные злодеи, такие, как Карнаж, Веном, и Хобгоблин. Во время своих приключений у Питера Паркера завязываются романтические отношения с Мэри Уотсон и Фелицией Харди или Чёрной Кошкой.